Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ3O43525 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms