Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEFVO15553 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEFVO15553 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEFVO15553 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEFVO15553 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEFVO15553 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEFVO15553 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEFVO15553 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEFVO15553 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEFVO15553 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms