Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM6AO15550 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms