Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP290O15078 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP290O15078 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP290O15078 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP290O15078 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP290O15078 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP290O15078 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP290O15078 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP290O15078 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP290O15078 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP290O15078 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP290O15078 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP290O15078 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP290O15078 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP290O15078 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP290O15078 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP290O15078 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP290O15078 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP290O15078 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP290O15078 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP290O15078 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP290O15078 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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