Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIPC1O14908 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms