Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC80O14777 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC80O14777 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC80O14777 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC80O14777 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC80O14777 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC80O14777 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDC80O14777 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms