Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX1O00570 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX1O00570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX1O00570 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX1O00570 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX1O00570 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX1O00570 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX1O00570 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX1O00570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX1O00570 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX1O00570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX1O00570 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX1O00570 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX1O00570 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX1O00570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX1O00570 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms