Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3B1O00203 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP3B1O00203 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms