Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARVCFO00192 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARVCFO00192 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARVCFO00192 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms