Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
I3L3M4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
I3L3M4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
I3L3M4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
I3L3M4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
I3L3M4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
I3L3M4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
I3L3M4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
I3L3M4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
I3L3M4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms