Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQV1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQV1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQV1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQV1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
H3BQV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
H3BQV1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQV1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQV1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQV1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQV1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms