Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8VWA3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8VWA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F8VWA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8VWA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
F8VWA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8VWA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8VWA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8VWA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
F8VWA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms