Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP99D6REC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP99D6REC4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms