Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ18B7U540 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ18B7U540 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms