Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A8MVJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MVJ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MVJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
A8MVJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MVJ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MVJ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MVJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms