Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL1BA8MQ27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL1BA8MQ27 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms