Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOBPA7XYQ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOBPA7XYQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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