Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNCNA6PVL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms