Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIIAD1A6NNX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIIAD1A6NNX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms