Protein–RNA interactions for Protein: A6NNN8

SLC38A8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A8A6NNN8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A8A6NNN8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A8A6NNN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms