Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD3A6NKT7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms