Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8B2A6NJW9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD8B2A6NJW9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms