Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRN3P2A6NIE6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3P2A6NIE6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms