Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN8A6NHC0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN8A6NHC0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN8A6NHC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms