Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPN1LA6NDY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PABPN1LA6NDY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PABPN1LA6NDY0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms