Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3B2A6NCE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms