Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms