Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XIRP2A4UGR9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XIRP2A4UGR9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XIRP2A4UGR9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms