Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXY3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms