Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
A0A0J9YVX5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YVX5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YVX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms