Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms