Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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