Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms