Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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