Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms