Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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