Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL3P36405 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL3P36405 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms