Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN2P17655 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms