Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI3P10071 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI3P10071 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms