Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NIPSNAP2O75323 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms