Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms