Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms