Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms