Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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