Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRX5P78411 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRX5P78411 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRX5P78411 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRX5P78411 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms