Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms