Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA13P31271 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms