Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ITGA3P26006 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ITGA3P26006 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms