Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINC1P01008 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms