Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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